Warga binaan Lapas Magelang melaksanakan rangkaian kegiatan keagamaan sebagai wujud pembinaan mental dan rohani. WBP beragama Islam mengadakan kegiatan rohani di masjid, di mana mereka melaksanakan sholat berjamaah dan mendengarkan tausiyah dari ustadz. Sementara itu, WBP yang beragama Nasrani juga mengadakan kebaktian di gereja lapas yang dipimpin oleh pendeta. Kegiatan ini bertujuan untuk memperkuat spiritualitas dan membangun rasa kebersamaan di antara warga binaan. Pihak lapas berharap pembinaan ini dapat mendukung proses rehabilitasi dan meningkatkan kesadaran akan pentingnya toleransi antar umat beragama di lingkungan lapas.